{"id":793,"date":"2026-05-06T13:12:48","date_gmt":"2026-05-06T13:12:48","guid":{"rendered":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793"},"modified":"2026-05-06T13:15:18","modified_gmt":"2026-05-06T13:15:18","slug":"kako-analiziramo-mikrobiom-tla","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793","title":{"rendered":"Kako analiziramo mikrobiom tla?"},"content":{"rendered":"\n

Kako analiziramo mikrobiom tla?<\/h3>\n\n\n\n

Kako bismo stekli saznanja o mikrobiomu tla moramo ga mo\u0107i kvalitetno analizirati \u0161to nije jednostavan zadatak budu\u0107i da se sastoji od razli\u010ditih tipova organizama – bakterija, gljiva, arheja, pra\u017eivotinja, algi, cijanobakterija.<\/p>\n\n\n\n

Razvijen je \u010ditav niz metoda analize koje se razlikuju u svojoj kompleksnosti te vrsti informacije koju daju \u2013 od ukupne biomase mikroorganizama do njihove aktivnosti, stoga je pri odabiru analize va\u017eno znati \u0161to zapravo \u017eelimo saznati.<\/p>\n\n\n\n

Metode analize mikrobioma<\/h4>\n\n\n\n

Jedna od klasi\u010dnih metoda koje se nalaze u \u0161irokoj upotrebi zbog niske cijene i jednostavnosti je analiza fosfolipidnih masnih kiselina<\/strong> (PLFA). Temelji se na analizi fosfolipida koji \u010dine stani\u010dne membrane mikroorganizama. Budu\u0107i da razli\u010dite skupine organizama imaju karakteristi\u010dne lipidne profile, mogu\u0107e je razlikovati, primjerice, bakterije i gljive te dobiti procjenu ukupne biomase mikroorganizama i uvid u strukturu zajednice kroz omjere pojedinih skupina.<\/p>\n\n\n\n

Za precizniju kvantifikaciju \u010desto se koristi qPCR<\/strong> (kvantitativna lan\u010dana reakcija polimerazom) koji omogu\u0107uje ciljano umno\u017eavanje karakteristi\u010dnih dijelova DNA za odre\u0111enu skupinu, poput 16S rRNA gena za bakterije ili ITS regije za gljive. Na taj na\u010din mo\u017eemo detektirati prisutnost odre\u0111enih skupina organizama te ih kvantificirati, a u nekim slu\u010dajevima kod ciljanih analiza dobiti i informacije o njihovim funkcionalnim mogu\u0107nostima.<\/p>\n\n\n\n

Jo\u0161 jedan va\u017ean pristup je DNA barkodiranje<\/strong>. Ova metoda uklju\u010duje PCR umna\u017eanje specifi\u010dnih genetskih markera, nakon \u010dega slijedi njihovo sekvenciranje. Dobiveni podaci omogu\u0107uju identifikaciju organizama \u010desto do razine roda, ponekad i vrste. Barkodiranje se mo\u017ee primijeniti na bakterije, gljive, arheje, a ponekad i alge, te daje vrijedan uvid u bioraznolikost i relativnu zastupljenost pojedinih organizama u uzorku.<\/p>\n\n\n\n

Napredniji pristup predstavlja metagenomika<\/strong>, koja uklju\u010duje sekvenciranje ukupne DNA iz uzorka tla. Ova metoda omogu\u0107uje vrlo detaljan uvid u sastav mikrobioma, \u010desto do razine vrste ili \u010dak soja. Osim toga, metagenomika otkriva i funkcionalni potencijal zajednice \u2013 odnosno koje metaboli\u010dke procese mikroorganizmi potencijalno mogu obavljati tj. koji geni su prisutni.<\/p>\n\n\n\n

Na kraju, metatranskriptomika<\/strong> ide korak dalje jer analizira aktivnost gena. Sekvenciranjem cDNA, koja nastaje na temelju RNA, dobivamo informaciju o tome koji se geni aktivni u trenutku uzimanja uzorka.<\/p>\n\n\n\n

Mogu\u0107nosti za istra\u017eivanje i primjenu su broje<\/strong><\/h4>\n\n\n\n

Metagenomika i metatranskriptomika temelj su velike ekspanzije znanja o mikrobiomu tla budu\u0107i da metagenomika detaljno prikazuje koji su organizmi prisutni i koje sve procese imaju mogu\u0107nost obavljati, a metatranskriptomika otkriva \u0161to zapravo rade u danim uvjetima. Spoj tih informacija omogu\u0107uje nam istra\u017eivati kako se mikrobiom pona\u0161a u razli\u010ditim uvjetima tj. kako se sastav i uloge zajednice mijenjanju kao odgovor na razne \u010dimbenike poput klimatski promjena, bolesti i sli\u010dno. Rezultat svega je sve vi\u0161e prakti\u010dnih rje\u0161enja koja su u skladu s o\u010duvanjem zdravlja tla, njegovom regeneracijom, minimizacijom utjecaja klimatskih promjena te odr\u017eivo\u0161\u0107u u proizvodnji hrane.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Kako analiziramo mikrobiom tla? Kako bismo stekli saznanja o mikrobiomu tla moramo ga mo\u0107i kvalitetno analizirati \u0161to nije jednostavan zadatak budu\u0107i da se sastoji od razli\u010ditih tipova organizama – bakterija, gljiva, arheja, pra\u017eivotinja, algi, cijanobakterija. Razvijen je \u010ditav niz metoda analize koje se razlikuju u svojoj kompleksnosti te vrsti informacije koju daju \u2013 od ukupne […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"saved_in_kubio":false,"footnotes":""},"categories":[1],"tags":[],"class_list":["post-793","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-uncategorized"],"yoast_head":"\nKako analiziramo mikrobiom tla? -<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"en_US\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Kako analiziramo mikrobiom tla? -\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Kako analiziramo mikrobiom tla? Kako bismo stekli saznanja o mikrobiomu tla moramo ga mo\u0107i kvalitetno analizirati \u0161to nije jednostavan zadatak budu\u0107i da se sastoji od razli\u010ditih tipova organizama – bakterija, gljiva, arheja, pra\u017eivotinja, algi, cijanobakterija. Razvijen je \u010ditav niz metoda analize koje se razlikuju u svojoj kompleksnosti te vrsti informacije koju daju \u2013 od ukupne […]\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2026-05-06T13:12:48+00:00\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2026-05-06T13:15:18+00:00\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"admin\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Written by\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"admin\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Est. reading time\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2 minutes\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793\",\"url\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793\",\"name\":\"Kako analiziramo mikrobiom tla? -\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/#website\"},\"datePublished\":\"2026-05-06T13:12:48+00:00\",\"dateModified\":\"2026-05-06T13:15:18+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/baee83eea51cfdd55c5c77b0e11ecf0c\"},\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"en-US\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Kako analiziramo mikrobiom tla?\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/#website\",\"url\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/\",\"name\":\"\",\"description\":\"\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"en-US\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/baee83eea51cfdd55c5c77b0e11ecf0c\",\"name\":\"admin\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"en-US\",\"@id\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/ddd66a7253ca3a4cf9ddccbdeaea0775?s=96&d=mm&r=g\",\"contentUrl\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/ddd66a7253ca3a4cf9ddccbdeaea0775?s=96&d=mm&r=g\",\"caption\":\"admin\"},\"sameAs\":[\"https:\/\/genkonekt.hr\"],\"url\":\"https:\/\/genkonekt.hr\/?author=1\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Kako analiziramo mikrobiom tla? -","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793","og_locale":"en_US","og_type":"article","og_title":"Kako analiziramo mikrobiom tla? -","og_description":"Kako analiziramo mikrobiom tla? Kako bismo stekli saznanja o mikrobiomu tla moramo ga mo\u0107i kvalitetno analizirati \u0161to nije jednostavan zadatak budu\u0107i da se sastoji od razli\u010ditih tipova organizama – bakterija, gljiva, arheja, pra\u017eivotinja, algi, cijanobakterija. Razvijen je \u010ditav niz metoda analize koje se razlikuju u svojoj kompleksnosti te vrsti informacije koju daju \u2013 od ukupne […]","og_url":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793","article_published_time":"2026-05-06T13:12:48+00:00","article_modified_time":"2026-05-06T13:15:18+00:00","author":"admin","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Written by":"admin","Est. reading time":"2 minutes"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793","url":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793","name":"Kako analiziramo mikrobiom tla? -","isPartOf":{"@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/#website"},"datePublished":"2026-05-06T13:12:48+00:00","dateModified":"2026-05-06T13:15:18+00:00","author":{"@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/baee83eea51cfdd55c5c77b0e11ecf0c"},"breadcrumb":{"@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793#breadcrumb"},"inLanguage":"en-US","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/?p=793#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/genkonekt.hr\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Kako analiziramo mikrobiom tla?"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/#website","url":"https:\/\/genkonekt.hr\/","name":"","description":"","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/genkonekt.hr\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"en-US"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/baee83eea51cfdd55c5c77b0e11ecf0c","name":"admin","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"en-US","@id":"https:\/\/genkonekt.hr\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/ddd66a7253ca3a4cf9ddccbdeaea0775?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/ddd66a7253ca3a4cf9ddccbdeaea0775?s=96&d=mm&r=g","caption":"admin"},"sameAs":["https:\/\/genkonekt.hr"],"url":"https:\/\/genkonekt.hr\/?author=1"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/793"}],"collection":[{"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=793"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/793\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":796,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/793\/revisions\/796"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=793"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=793"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/genkonekt.hr\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=793"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}